腦積水的病理改變為腦室系統逐漸擴大，第三腦室向下方隆起壓迫垂體及視神經交叉部，導致腦積水患者的透明隔穿破，腦實質變薄，以額葉處最明顯，甚至穿破腦積水患者的側腦室與蛛網膜下腔相通部位。胼胝體、錐體束、基底節、四疊體、脈絡叢及腦干等處都可能長期受壓迫而萎縮。
腦積水的病理改變為腦室系統逐漸擴大，第三腦室向下方隆起壓迫垂體及視神經交叉部，透明隔可穿破，腦實質變薄，以額葉處最明顯，甚至穿破側腦室與蛛網膜…
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